A SHD CATALYTIC TRIAD
A SHD katalitikus triádamint azt a neve is jelzi, az aminosavakból (AA) szerinből, hisztidinből és aszpartátból áll, amelyek egy betűs kódjai S, H és D.
Ilyen triad létezik például az enzimen belül tripszin, ami megtalálható a hasnyálmirigyben, amelyet először inaktív prekurzorként szintetizálnak (így a feladatot addig nem végezzük, amíg szükség van rá).
TRYPSIN CUTS SPECIFIC PEPTIDE BONDS
A tripszin ötlete az, hogy feltételezhetően specifikus peptidkötéseket hidrolizál, ahol a kérdéses peptidkötés egy specifikus
A kiemelt kötés a peptidkötés, amely az enzimatikus aktivitás során hidrolizálódik a kiemelt hely megtalálásakor
AMINO-SZEREPEK
szerin ebben a triádban nagyszerű lenne nukleofil, ha nem a protonnak. A deprotonálódás valóban segítene. Ennek eléréséhez valamit kell elérnünk a szerin pKa-értékének csökkentése úgy, hogy el akarja adni a protonját.
hisztidin kívánatos megoldássá válik, ha egy aktivátor szerinre. Mivel a hisztidin pKa értéke körülbelül 6,04, és a semleges szerin pKa értéke körülbelül 15,9, önmagában valószínűtlen, hogy ez megtörténjen …
Azonban, aszpartát pKa értéke körülbelül 3,90, és negatív töltés, így hidrofil vegyületként savként kíván lenni, hogy mind a hisztidin, mind az aszpartát egy H-kötő kölcsönhatást képezzen.
Az aszpartát hisztidin protonja iránti vágya a hisztidint készteti növelje pKa-ját hogy megtartsa a jobb felső protont, kiegyenlítés a hisztidin és a szerin közötti pKa-különbség, elősegítve a szerin deprotonálódását, hogy H-kötő kölcsönhatást képezzen.
További bónuszként az aszpartát is tájolja hisztidin, hogy szabadon forgó metilénhídja a helyén maradjon. Szép!
Ezek együttesen a tripszinen belül dolgoznak, például más fehérjék specifikus peptidkötéseinek hidrolízisét / hasítását.
MIÉRT A MECHANIZMUS?
Nos, ez itt a nagy diagram:
- A hisztidin egy protont ellop a szerinből, aktiválva azt.
- A serin most képes támadni a karbonil-szénatomot, és egy tetraéderes komplexben kötődik.
- A komplexet gerinc stabilizálja
# "NH" # egy közeli glicinből és ugyanazon szerinből. A hisztidin az aszpartát irányítja. A tetraéderes komplex összeomlik a peptidkötés és a keletkezett hasítás érdekében# "NH" # ellop egy protont a hisztidintől. - A hisztidin megragad egy protont a vízből, mivel pKa-ja még növekszik (gyengébb savvá teszi), miután az aszpartát stabilizálódott.
- A hidroxid egy nagy nukleofil, amely ezután támadhatja meg a második nukleofil támadás karbonil-szénét.
- A tetraéderes komplex, amelyet ismét a gerinc stabilizál
# "NH" # a glicin és ugyanaz a szerin, akkor összeomolhat, levághatja a szerint, és megragadja a protonot a hisztidinből, mint korábban. - Karbonsavval végzünk, amely egy peptidkötés hidrolízisének eredménye.
A városba közlekedő autók háromötödét minden reggel parkolják a városi parkolóhelyekbe. Ezek az autók 3654 parkolóhelyet töltenek be. Hány autó érkezik a városba minden reggel?
6 090 autó Ezt megtehetjük egy arány vagy egyenlet alapján. Fel kell ismernünk, hogy a 3/5 frakció 3654 autót képvisel az összes autóból. Tehát, ha 3 rész 3654 autót képvisel, hány autó képviseli az 5 alkatrészt? 3/5 = 3654 / x "vagy" 3/5 xx 1218/1218 = 3654 / xx = (5xx3654) / 3 x = 6,090 Egy egyenlet használatával azt mondjuk, hogy: 3/5 egy bizonyos számú autóról 3654 Ha az autók száma x, akkor: 3/5 xx x = 3654 x = (5xx3654) / 3 "" ugyanaz a számítás x =
Milyen szerepet töltenek be a plasztidok a növény életében?
A plasztidok segítenek a fotoszintézisben, színezésben és az élelmiszer fenntartásában. 1. A plasztidok háromféle, a kloroplaszt, a kromoplaszt és a leukoplaszt. Mindegyik cserélhető. 2. A kloroplasztok a fotoszintézis helyszínei. 3. A zöld színt a kromoplasztok jelenléte határozza meg. 4. Az élelmiszeranyagokat leukoplasztokban tartják fenn. Köszönöm
Az amerikai szenátusnak 100 tagja van. Egy bizonyos választás után 4 további demokrata volt, mint a republikánusok. Az egyes pártok hány tagja volt a szenátusban?
48 republikánus és 52 demokrata. Legyen a republikánusok száma x. Vannak x + 4 demokraták. Így az x + (x + 4) = 100 imples2x = 100-4 azt jelenti, hogy x = 96/2 = 48 48 + 4 = 52 demokrata van.